Homo sapiens Gene: SORT1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-100814.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SORT1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | sortilin 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Gp95; LDLCQ6; NT3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000134243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sortilin 1
sortilin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein that is a multi-ligand type-1 receptor with similarity to the yeast carboxypeptidase Y sorting receptor Vps10 protein. The encoded protein, a trans-Golgi network (TGN) transmembrane protein, binds a number of unrelated ligands that participate in a wide range of cellular processes; however, it lacks the typical features of a signalling receptor. In the TGN, furin mediates the activation of the mature binding form. The encoded protein consists of a large luminal domain, a single transmembrane segment and short C-terminal cytoplasmic tail. The luminal domain contains a cysteine-rich region similar to two corresponding segments in the yeast Vps10p; the cytoplasmic tail is similar to the corresponding segment of the cation-independent mannose 6-phosphate receptor and the tail also interacts with the VHS domains of GGA (Golgi-associated, gamma-adaptin homologous, ARF-interacting) proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:109309568-109397951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 30 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG |
Lysosome pathway
Neurotrophin signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
p75(NTR)-mediated signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.485195 Hs.703487 Hs.707752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001205228 NM_002959 XM_005271100 XM_005271101 XM_005271102 XM_006710812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS55618 CCDS798 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03910 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||