Homo sapiens Gene: VTCN1 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-101440.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | VTCN1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | V-set domain containing T cell activation inhibitor 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000134258 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
V-set domain containing T cell activation inhibitor 1
V-set domain containing T cell activation inhibitor 1
V-set domain containing T cell activation inhibitor 1
V-set domain containing T cell activation inhibitor 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein belonging to the B7 costimulatory protein family. Proteins in this family are present on the surface of antigen-presenting cells and interact with ligand bound to receptors on the surface of T cells. Studies have shown that high levels of the encoded protein has been correlated with tumor progression. A pseudogene of this gene is located on chromosome 20. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:117143587-117210960 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p12 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||
KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.546434 Hs.622264 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001253849 NM_001253850 NM_024626 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS58019 CCDS58020 CCDS894 | ||||||||||||||||||
HPRD | 06429 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||