Homo sapiens Gene: CBX3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-10171.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CBX3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | chromobox homolog 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | HECH; HP1-GAMMA; HP1Hs-gamma | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000122565 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chromobox homolog 3
chromobox homolog 3
chromobox homolog 3
chromobox homolog 3
chromobox homolog 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
At the nuclear envelope, the nuclear lamina and heterochromatin are adjacent to the inner nuclear membrane. The protein encoded by this gene binds DNA and is a component of heterochromatin. This protein also can bind lamin B receptor, an integral membrane protein found in the inner nuclear membrane. The dual binding functions of the encoded protein may explain the association of heterochromatin with the inner nuclear membrane. This protein binds histone H3 tails methylated at Lys-9 sites. This protein is also recruited to sites of ultraviolet-induced DNA damage and double-strand breaks. Two transcript variants encoding the same protein but differing in the 5' UTR, have been found for this gene.[provided by RefSeq, Mar 2011] At the nuclear envelope, the nuclear lamina and heterochromatin are adjacent to the inner nuclear membrane. The protein encoded by this gene binds DNA and is a component of heterochromatin. This protein also can bind lamin B receptor, an integral membrane protein found in the inner nuclear membrane. The dual binding functions of the encoded protein may explain the association of heterochromatin with the inner nuclear membrane. This protein binds histone H3 tails methylated at Lys-9 sites. This protein is also recruited to sites of ultraviolet-induced DNA damage and double-strand breaks. Two transcript variants encoding the same protein but differing in the 5\' UTR, have been found for this gene.[provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:26201162-26213356 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p15.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 126 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase I Chain Elongation pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.381189 Hs.713913 Hs.717386 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007276 NM_016587 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5398 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 05130 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||