Homo sapiens Gene: ARNT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-102199.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ARNT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | bHLHe2; HIF-1-beta; HIF-1beta; HIF1-beta; HIF1B; HIF1BETA; TANGO | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000143437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The aryl hydrocarbon (Ah) receptor is involved in the induction of several enzymes that participate in xenobiotic metabolism. The ligand-free, cytosolic form of the Ah receptor is complexed to heat shock protein 90. Binding of ligand, which includes dioxin and polycyclic aromatic hydrocarbons, results in translocation of the ligand-binding subunit only to the nucleus. Induction of enzymes involved in xenobiotic metabolism occurs through binding of the ligand-bound Ah receptor to xenobiotic responsive elements in the promoters of genes for these enzymes. This gene encodes a protein that forms a complex with the ligand-bound Ah receptor, and is required for receptor function. The encoded protein has also been identified as the beta subunit of a heterodimeric transcription factor, hypoxia-inducible factor 1. A t(1;12)(q21;p13) translocation, which results in a TEL-ARNT fusion protein, is associated with acute myeloblastic leukemia. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2010] This gene encodes a protein containing a basic helix-loop-helix domain and two characteristic PAS domains along with a PAC domain. The encoded protein binds to ligand-bound aryl hydrocarbon receptor and aids in the movement of this complex to the nucleus, where it promotes the expression of genes involved in xenobiotic metabolism. This protein is also a co-factor for transcriptional regulation by hypoxia-inducible factor 1. Chromosomal translocation of this locus with the ETV6 (ets variant 6) gene on chromosome 12 have been described in leukemias. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Oct 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:150809705-150876768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 71 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 12 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
Regulation of gene expression by Hypoxia-inducible Factor pathway
Cellular responses to stress pathway
Regulation of Hypoxia-inducible Factor (HIF) by oxygen pathway
Cellular response to hypoxia pathway
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KEGG |
Renal cell carcinoma pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Notch-mediated HES/HEY network
HIF-2-alpha transcription factor network
HIF-1-alpha transcription factor network
Hypoxic and oxygen homeostasis regulation of HIF-1-alpha
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.632446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001197325 NM_001286035 NM_001286036 NM_001668 NM_178427 XM_005245151 XM_005245153 XM_005245154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS65641 CCDS65642 CCDS970 CCDS971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||