Homo sapiens Gene: TNR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-104981.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TNR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tenascin R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | TN-R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000116147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tenascin R (restrictin, janusin)
tenascin R (restrictin, janusin)
tenascin R (restrictin, janusin)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Tenascin-R (TNR) is an extracellular matix protein expressed primarily in the central nervous system. It is a member of the tenascin (TN) gene family, which includes at least 3 genes in mammals: TNC (or hexabrachion; MIM 187380), TNX (TNXB; MIM 600985), and TNR (Erickson, 1993 [PubMed 7694605]). The genes are expressed in distinct tissues at different times during embryonic development and are present in adult tissues.[supplied by OMIM, Mar 2008] This gene encodes a member of the tenascin family of extracellular matrix glycoproteins. The encoded protein is restricted to the central nervous system. The protein may play a role in neurite outgrowth, neural cell adhesion and modulation of sodium channel function. It is a constituent of perineuronal nets. [provided by RefSeq, Aug 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:175315194-175743770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q25.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
ECM proteoglycans pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.659864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003285 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||