Homo sapiens Gene: RBBP5 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-106101.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBBP5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | retinoblastoma binding protein 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | RBQ3; SWD1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000117222 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
retinoblastoma binding protein 5
retinoblastoma binding protein 5
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a ubiquitously expressed nuclear protein which belongs to a highly conserved subfamily of WD-repeat proteins. The encoded protein binds directly to retinoblastoma protein, which regulates cell proliferation. It interacts preferentially with the underphosphorylated retinoblastoma protein via the E1A-binding pocket B. Three alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:205086142-205122015 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q32.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 112 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
misspliced LRP5 mutants have enhanced beta-catenin-dependent signaling pathway
Signaling by WNT in cancer pathway
Signaling by Wnt pathway
deactivation of the beta-catenin transactivating complex pathway
Signal Transduction pathway
TCF dependent signaling in response to WNT pathway
RNF mutants show enhanced WNT signaling and proliferation pathway
formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex pathway
XAV939 inhibits tankyrase, stabilizing AXIN pathway
Disease pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.519230 Hs.737357 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001193272 NM_001193273 NM_005057 XM_005245398 XM_005245399 XM_005245400 XM_005245401 XM_006711477 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30983 CCDS53463 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02826 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||