Homo sapiens Gene: OBSCN | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-107220.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | OBSCN | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000154358 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF
obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF
obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF
obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The obscurin gene spans more than 150 kb, contains over 80 exons and encodes a protein of approximately 720 kDa. The encoded protein contains 68 Ig domains, 2 fibronectin domains, 1 calcium/calmodulin-binding domain, 1 RhoGEF domain with an associated PH domain, and 2 serine-threonine kinase domains. This protein belongs to the family of giant sacromeric signaling proteins that includes titin and nebulin, and may have a role in the organization of myofibrils during assembly and may mediate interactions between the sarcoplasmic reticulum and myofibrils. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:228208130-228378876 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q42.13 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
NRAGE signals death through JNK pathway
G alpha (12/13) signalling events pathway
Rho GTPase cycle pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by Rho GTPases pathway
Signaling by GPCR pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
Cell death signalling via NRAGE, NRIF and NADE pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of RhoA activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001098623 NM_001271223 NM_052843 XM_006711828 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1570 CCDS58065 CCDS59204 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 10551 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||