Homo sapiens Gene: GABPA | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-1089.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GABPA | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | GA binding protein transcription factor, alpha subunit 60kDa | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | E4TF1-60; E4TF1A; NFT2; NRF2; NRF2A; RCH04A07 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000154727 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
GA binding protein transcription factor, alpha subunit 60kDa
GA binding protein transcription factor, alpha subunit 60kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes one of three GA-binding protein transcription factor subunits which functions as a DNA-binding subunit. Since this subunit shares identity with a subunit encoding the nuclear respiratory factor 2 gene, it is likely involved in activation of cytochrome oxidase expression and nuclear control of mitochondrial function. This subunit also shares identity with a subunit constituting the transcription factor E4TF1, responsible for expression of the adenovirus E4 gene. Because of its chromosomal localization and ability to form heterodimers with other polypeptides, this gene may play a role in the Down Syndrome phenotype. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 21:25734570-25772460 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q21.3 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 45 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q06546 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A8IE48 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 2551 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.473470 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001197297 NM_002040 XM_005260938 XM_005260939 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:4071 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600609 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13575 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | CH471079 D13318 EU159453 EU627790 JQ313900 U13044 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA65706 ABV90873 ACD11490 AFH41795 BAA02575 EAX09967 EAX09968 EAX09969 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 2551 | ||||||||||||||||||||||||