Homo sapiens Gene: LSM5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-11615.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | LSM5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | YER146W | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000106355 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Sm-like proteins were identified in a variety of organisms based on sequence homology with the Sm protein family (see SNRPD2; MIM 601061). Sm-like proteins contain the Sm sequence motif, which consists of 2 regions separated by a linker of variable length that folds as a loop. The Sm-like proteins are thought to form a stable heteromer present in tri-snRNP particles, which are important for pre-mRNA splicing.[supplied by OMIM, Apr 2004] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:32485332-32495283 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p14.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 28 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.424908 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001130710 NM_001139499 NM_012322 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47571 CCDS5438 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06285 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||