Homo sapiens Gene: RP9 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-11810.5 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RP9 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | retinitis pigmentosa 9 (autosomal dominant) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | PAP-1; PAP1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000164610 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
retinitis pigmentosa 9 (autosomal dominant)
retinitis pigmentosa 9 (autosomal dominant)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene can be bound and phosphorylated by the protooncogene PIM1 product, a serine/threonine protein kinase . This protein localizes in nuclear speckles containing the splicing factors, and has a role in pre-mRNA splicing. CBF1-interacting protein (CIR), a corepressor of CBF1, can also bind to this protein and effects alternative splicing. Mutations in this gene result in autosomal dominant retinitis pigmentosa-9. This gene has a pseudogene (GeneID: 441212), which is located in tandem array approximately 166 kb distal to this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:33094797-33109401 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p14.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8TA86 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9J6V2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6100 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.326805 Hs.593431 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_203288 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10288 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 607331 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5440 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC074338 AX016710 BC025928 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH25928 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6100 | ||||||||||||||||||||||