Mus musculus Gene: Dnmt3a | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-127800.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dnmt3a | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DNA methyltransferase 3A | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MmuIIIA | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020661 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
DNA methyltransferase 3A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This is one of two related genes encoding de novo DNA methyltransferases, which are responsible for the establishment of DNA methylation patterns in embryos. Loss of function of this gene causes developmental defects in multiple different organ systems. There is a pseudogene for this gene located on chromosome 3. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Nov 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:3806007-3914443 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 28 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 39 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Chromatin organization pathway
PRC2 methylates histones and DNA pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
DNA methylation pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
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KEGG |
Cysteine and methionine metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PRC2 methylates histones and DNA pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
DNA methylation pathway
Chromatin organization pathway
RMTs methylate histone arginines pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Cysteine and methionine metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated targets of C-MYC transcriptional repression
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.408117 Mm.421724 Mm.454591 Mm.454592 Mm.470389 Mm.5001 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001271753 NM_007872 NM_153743 XM_006514953 XM_006514954 XM_006514955 XM_006514956 XM_006514957 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25784 CCDS36397 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||