Mus musculus Gene: Snrpd1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-128492.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Snrpd1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein D1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA407109; AL023031; SMD1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000002477 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein D1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000167088:
This gene encodes a small nuclear ribonucleoprotein that belongs to the SNRNP core protein family. The protein may act as a charged protein scaffold to promote SNRNP assembly or strengthen SNRNP-SNRNP interactions through nonspecific electrostatic contacts with RNA. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene encodes a small nuclear ribonucleoprotein that belongs to the SNRNP core protein family. The protein may act as a charged protein scaffold to promote SNRNP assembly or strengthen SNRNP-SNRNP interactions through nonspecific electrostatic contacts with RNA. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:10617796-10628230 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 84 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
snRNP Assembly pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
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KEGG |
Systemic lupus erythematosus pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
snRNP Assembly pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Systemic lupus erythematosus pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.396467 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009226 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29056 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||