Mus musculus Gene: Clcn5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-128942.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Clcn5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | chloride channel 5 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5430408K11Rik; ClC-5; Clc5; D930009B12Rik; DXImx42e; Sfc13; T25545 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000004317 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chloride channel 5
chloride channel 5
chloride channel 5
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000171365:
This gene encodes a member of the ClC family of chloride ion channels and ion transporters. The encoded protein is primarily localized to endosomal membranes and may function to facilitate albumin uptake by the renal proximal tubule. Mutations in this gene have been found in Dent disease and renal tubular disorders complicated by nephrolithiasis. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2013] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:7153810-7319358 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A1.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Ion channel transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Stimuli-sensing channels pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Ion channel transport pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9WVD4 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8C6W8 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12728 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.254370 Mm.440363 Mm.445787 Mm.474200 Mm.482981 Mm.487049 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016691 XM_006527562 XM_006527563 NM_001243762 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29963 CCDS57727 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:99486 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Clcn5 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF134117 AK052990 AL808124 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD28473 BAC35233 CAM15287 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 12728 | ||||||||||||||||||||||