Mus musculus Gene: Cftr | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-129229.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cftr | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cystic fibrosis transmembrane conductance regulator | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Abcc7; AW495489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000041301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cystic fibrosis transmembrane conductance regulator homolog
cystic fibrosis transmembrane conductance regulator homolog
cystic fibrosis transmembrane conductance regulator homolog
cystic fibrosis transmembrane conductance regulator homolog
cystic fibrosis transmembrane conductance regulator homolog
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Cftr deficiency alters the innate immunity of the biliary epithelium and reduces endotoxin tolerance, resulting in increased inflammatory response mediated by Tlr4 and NFkB.
Cftr is involved in myeloid cell function and its absence from myeloid-derived cells slows resolution of inflammation and infection of the lung.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] CFTR deficiency alters the innate immunity of the biliary epithelium and reduces endotoxin tolerance, resulting in increased inflammatory response mediated by TLR4 and NFkB.
[Homo sapiens] CFTR is involved in myeloid cell function and its absence from myeloid-derived cells slows resolution of inflammation and infection of the lung. (Demonstrated in mouse)
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The membrane-associated protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the MRP subfamily which is involved in multi-drug resistance. This gene encodes the cystic fibrosis transmembrane regulator and a chloride channel that controls the regulation of other transport pathways. Mutations in this gene have been associated with autosomal recessive disorders such as cystic fibrosis and congenital bilateral aplasia of the vas deferens. Alternative splicing of exons 4, 5, and 11 have been observed, but full-length transcripts have not yet been fully described. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:18170687-18322768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 211 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transmembrane transport of small molecules pathway
ABC-family proteins mediated transport pathway
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KEGG |
ABC transporters pathway
Gastric acid secretion pathway
Bile secretion pathway
Pancreatic secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
ABC-family proteins mediated transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
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KEGG |
Vibrio cholerae infection pathway
ABC transporters pathway
Gastric acid secretion pathway
Pancreatic secretion pathway
Bile secretion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P26361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.15621 Mm.445229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021050 XM_006504977 XM_006504978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:88388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cftr | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF162137 L04873 M60493 M69298 S65940 S65941 S65942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA18903 AAA37417 AAA73562 AAB28391 AAB28392 AAB28393 AAF30300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 12638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||