Mus musculus Gene: Trio | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131599.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trio | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | triple functional domain (PTPRF interacting) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022263 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
triple functional domain (PTPRF interacting)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000038382:
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:27730652-28025848 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 15 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
GPCR downstream signaling pathway
Signaling by GPCR pathway
Netrin-1 signaling pathway
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK pathway
NRAGE signals death through JNK pathway
DCC mediated attractive signaling pathway
Signaling by Rho GTPases pathway
Cell death signalling via NRAGE, NRIF and NADE pathway
G alpha (12/13) signalling events pathway
Axon guidance pathway
Rho GTPase cycle pathway
Signalling by NGF pathway
Developmental Biology pathway
G alpha (q) signalling events pathway
Signal Transduction pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
NRAGE signals death through JNK pathway
G alpha (q) signalling events pathway
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK pathway
G alpha (12/13) signalling events pathway
Rho GTPase cycle pathway
DCC mediated attractive signaling pathway
Netrin-1 signaling pathway
Developmental Biology pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by Rho GTPases pathway
Signaling by GPCR pathway
Axon guidance pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
Cell death signalling via NRAGE, NRIF and NADE pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of RAC1 activity
Netrin-mediated signaling events
Regulation of RhoA activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.485422 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081302 XM_006520050 XM_006520051 XM_006520052 XM_006520053 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS49587 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||