Mus musculus Gene: Abat | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131633.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Abat | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | 4-aminobutyrate aminotransferase | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000057880 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
4-aminobutyrate aminotransferase
4-aminobutyrate aminotransferase
4-aminobutyrate aminotransferase
4-aminobutyrate aminotransferase
4-aminobutyrate aminotransferase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
The encoded gene product is responsible for catabolism of gamma-aminobutyric acid (GABA), a mostly inhibitory neurotransmitter in the central nervous system, into succinic semialdehyde. Deficiency of this encoded protein includes psychomotor retardation, hypotonia, hyperreflexia, lethargy, refractory seizures, and EEG abnormalities. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:8513429-8621568 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
GABA synthesis, release, reuptake and degradation pathway
Degradation of GABA pathway
Neurotransmitter Release Cycle pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
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KEGG |
beta-Alanine metabolism pathway
Valine, leucine and isoleucine degradation pathway
Propanoate metabolism pathway
Butanoate metabolism pathway
Alanine, aspartate and glutamate metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Degradation of GABA pathway
GABA synthesis, release, reuptake and degradation pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Neurotransmitter Release Cycle pathway
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KEGG |
Valine, leucine and isoleucine degradation pathway
Butanoate metabolism pathway
Propanoate metabolism pathway
beta-Alanine metabolism pathway
Alanine, aspartate and glutamate metabolism pathway
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INOH |
Glutamate Glutamine metabolism pathway
Arginine Proline metabolism pathway
Pyrimidine nucleotides nucleosides metabolism pathway
Alanine Aspartate Asparagine metabolism pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.259315 Mm.397170 Mm.480038 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001170978 NM_172961 XM_006522195 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27939 CCDS49754 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||