Mus musculus Gene: Otc | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131648.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Otc | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ornithine transcarbamylase | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI265390; Sf; spf | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ornithine transcarbamylase
ornithine transcarbamylase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000036473:
This nuclear gene encodes a mitochondrial matrix enzyme. Missense, nonsense, and frameshift mutations in this enzyme lead to ornithine transcarbamylase deficiency, which causes hyperammonemia. Since the gene for this enzyme maps close to that for Duchenne muscular dystrophy, it may play a role in that disease also. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:10252305-10321024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Metabolism pathway
Urea cycle pathway
Metabolism of amino acids and derivatives pathway
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KEGG |
Arginine and proline metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Urea cycle pathway
Metabolism of amino acids and derivatives pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Arginine and proline metabolism pathway
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INOH |
Arginine Proline metabolism pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P11725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q543H3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.2611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:97448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Otc | ||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK050930 CH466584 M12716 M17030 X07092 X07093 X07094 X07095 X07096 X07097 X07098 X07099 X07100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA39864 AAA39865 BAC34465 CAA30121 EDL35673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 18416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||