Mus musculus Gene: Sema3a | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-135492.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sema3a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | coll-1; Hsema-I; SEMA1; Semad; SemD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3A
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3A
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3A
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3A
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Sema3a is a ligand for Plxna4, and the overexpression of Sema3a exacerbate cytokine storm caused by Tlr agonist and bacterial sepsis. The expression of Sema3a can be induced by Tlr engagement, and thus completes an autocrine loop.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] SEMA3A is a ligand for PLXNA4, and the overexpression of SEMA3A exacerbate cytokine storm caused by TLR agonist and bacterial sepsis. The expression of SEMA3A can be induced by TLR engagement, and thus completes an autocrine loop.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000075213:
This gene is a member of the semaphorin family and encodes a protein with an Ig-like C2-type (immunoglobulin-like) domain, a PSI domain and a Sema domain. This secreted protein can function as either a chemorepulsive agent, inhibiting axonal outgrowth, or as a chemoattractive agent, stimulating the growth of apical dendrites. In both cases, the protein is vital for normal neuronal pattern development. Increased expression of this protein is associated with schizophrenia and is seen in a variety of human tumor cell lines. Also, aberrant release of this protein is associated with the progression of Alzheimer's disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] This gene is a member of the semaphorin family and encodes a protein with an Ig-like C2-type (immunoglobulin-like) domain, a PSI domain and a Sema domain. This secreted protein can function as either a chemorepulsive agent, inhibiting axonal outgrowth, or as a chemoattractive agent, stimulating the growth of apical dendrites. In both cases, the protein is vital for normal neuronal pattern development. Increased expression of this protein is associated with schizophrenia and is seen in a variety of human tumor cell lines. Also, aberrant release of this protein is associated with the progression of Alzheimer\'s disease. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:13396784-13602565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
SEMA3A-Plexin repulsion signaling by inhibiting Integrin adhesion pathway
Sema3A PAK dependent Axon repulsion pathway
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
CRMPs in Sema3A signaling pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
CRMPs in Sema3A signaling pathway
Sema3A PAK dependent Axon repulsion pathway
SEMA3A-Plexin repulsion signaling by inhibiting Integrin adhesion pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.372039 Mm.406026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001243072 NM_001243073 NM_009152 XM_006503557 XM_006503558 XM_006503559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||