Mus musculus Gene: Sra1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-138270.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sra1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | steroid receptor RNA activator 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA959952; Sra; Srap; Straa1; Strra1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000006050 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
steroid receptor RNA activator 1
steroid receptor RNA activator 1
steroid receptor RNA activator 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000213523:
Both long non-coding and protein-coding RNAs are transcribed from this gene, and they represent alternatively spliced transcript variants. This gene was initially defined as a non-coding RNA, which is a coactivator for several nuclear receptors (NRs) and is associated with breast cancer. It has now been found that this gene is involved in the regulation of many NR and non-NR activities, including metabolism, adipogenesis and chromatin organization. The long non-coding RNA transcripts interact with a variety of proteins, including the protein encoded by this gene. The encoded protein acts as a transcriptional repressor by binding to the non-coding RNA. [provided by RefSeq, Mar 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:36666681-36679366 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 41 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated nuclear estrogen receptor alpha network
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.29058 Mm.484305 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_025291 NM_146085 XM_006525861 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29156 CCDS29157 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||