Mus musculus Gene: Lamp2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-140038.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lamp2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysosomal-associated membrane protein 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD107b; Lamp II; Lamp-2; Lamp-2a; Lamp-2b; Lamp-2c; LGP-B; Mac3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000016534 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysosomal-associated membrane protein 2
lysosomal-associated membrane protein 2
lysosomal-associated membrane protein 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000005893:
The protein encoded by this gene is a member of a family of membrane glycoproteins. This glycoprotein provides selectins with carbohydrate ligands. It may play a role in tumor cell metastasis. It may also function in the protection, maintenance, and adhesion of the lysosome. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding distinct proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:38401357-38456454 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A3.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 33 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Platelet degranulation pathway
Hemostasis pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
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KEGG |
Lysosome pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Platelet degranulation pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Lysosome pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P17047 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8C5K0 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16784 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.393333 Mm.395238 Mm.399636 Mm.400366 Mm.414016 Mm.418582 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001017959 NM_001290485 NM_010685 XM_006541430 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30092 CCDS30093 CCDS72369 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:96748 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Lamp2 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK032974 AK078193 AK159272 AK163933 AL513356 BC138718 BC138723 CH466570 J05287 M32017 M32018 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA39412 AAA39429 AAA39430 AAI38719 AAI38724 BAC28106 BAC37169 BAE34951 BAE37543 CAM17143 CAM17144 EDL29015 EDL29016 EDL29018 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 16784 | ||||||||||||||||||||||