Mus musculus Gene: Rp9 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-144027.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rp9 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | retinitis pigmentosa 9 (human) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | PAP-1; Rp9h | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032239 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
retinitis pigmentosa 9 (human)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000164610:
The protein encoded by this gene can be bound and phosphorylated by the protooncogene PIM1 product, a serine/threonine protein kinase . This protein localizes in nuclear speckles containing the splicing factors, and has a role in pre-mRNA splicing. CBF1-interacting protein (CIR), a corepressor of CBF1, can also bind to this protein and effects alternative splicing. Mutations in this gene result in autosomal dominant retinitis pigmentosa-9. This gene has a pseudogene (GeneID: 441212), which is located in tandem array approximately 166 kb distal to this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:22448311-22468356 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P97762 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3TH81 Q4VA23 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 55934 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_018739 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40564 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2157166 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rp9 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK168391 BC096578 BC115549 BC115550 CH466522 D78255 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH96578 AAI15550 AAI15551 BAA11319 BAE40317 EDL25277 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 55934 | ||||||||||||||||||||||