Mus musculus Gene: Exosc3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-144083.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Exosc3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | exosome component 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2310005D06Rik; AI593501; Rrp40 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028322 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
exosome component 3
exosome component 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000107371:
This gene encodes a non-catalytic component of the human exosome, a complex with 3'-5' exoribonuclease activity that plays a role in numerous RNA processing and degradation activities. Related pseudogenes of this gene are found on chromosome 19 and 21. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jun 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:45316613-45342732 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 18 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease pathway
Regulation of mRNA stability by proteins that bind AU-rich elements pathway
KSRP destabilizes mRNA pathway
Gene Expression pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Butyrate Response Factor 1 (BRF1) destabilizes mRNA pathway
Tristetraprolin (TTP) destabilizes mRNA pathway
KSRP destabilizes mRNA pathway
mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease pathway
ATF4 activates genes pathway
PERK regulates gene expression pathway
Unfolded Protein Response (UPR) pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Metabolism of proteins pathway
Regulation of mRNA stability by proteins that bind AU-rich elements pathway
Gene Expression pathway
KSRP destabilizes mRNA pathway
PERK regulates gene expression pathway
Regulation of mRNA stability by proteins that bind AU-rich elements pathway
ATF4 activates genes pathway
Gene Expression pathway
Metabolism of proteins pathway
mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease pathway
Unfolded Protein Response (UPR) pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.275788 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_025513 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18136 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||