Mus musculus Gene: Atg12 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-145432.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Atg12 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | autophagy related 12 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4931423H11Rik; A330058M13Rik; Apg12l; Atg12l | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032905 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
autophagy-related 12 (yeast)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Atg12::Atg5 conjugate is a key regulator of the autophagic process to eliminate pathogens such as Streptococcus, M. tuberculosis, Listeria, and herpesvirus. Atg12::Atg5 also associates with components of the RIG-I pathway to negatively regulate type I IFN response and promote RNA virus replication.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] ATG12::ATG5 conjugate is a key regulator of the autophagic process to eliminate pathogens such as Streptococcus, M. tuberculosis, Listeria, and herpesvirus. ATG12::ATG5 also associates with components of the RIG-I pathway to negatively regulate type I IFN response and promote RNA virus replication.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000145782:
Autophagy is a process of bulk protein degradation in which cytoplasmic components, including organelles, are enclosed in double-membrane structures called autophagosomes and delivered to lysosomes or vacuoles for degradation. ATG12 is the human homolog of a yeast protein involved in autophagy (Mizushima et al., 1998 [PubMed 9852036]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:46732417-46741579 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 17 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 65 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Innate Immune System pathway
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
Immune System pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
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KEGG |
Regulation of autophagy pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Negative regulators of RIG-I/MDA5 signaling pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
Innate Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Regulation of autophagy pathway
RIG-I-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9CQY1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67526 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.399737 Mm.9852 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_026217 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37811 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1914776 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Atg12 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AB066216 AK005405 AK008698 AK016474 AK167027 BC070470 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH70470 BAB24005 BAB25839 BAB30256 BAB62092 BAE39200 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 67526 | ||||||||||||||||||||||