Mus musculus Gene: Sema6a | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-145724.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sema6a | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 9330158E07; A730020P05Rik; AI851735; b2b997Clo; Sema6A-1; Semaq; VIa | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000019647 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000092421:
The transmembrane semaphorin SEMA6A is expressed in developing neural tissue and is required for proper development of the thalamocortical projection (Leighton et al., 2001 [PubMed 11242070]).[supplied by OMIM, Feb 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:47235598-47368870 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Axon guidance pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Other semaphorin interactions pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Other semaphorin interactions pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O35464 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3YZJ8 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20358 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.397257 Mm.405772 Mm.40909 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_018744 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37813 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1203727 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Sema6a | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC121783 AC124466 AF030430 AF288666 BC059238 BC062979 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB86408 AAG29494 AAH59238 AAH62979 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20358 | ||||||||||||||||||||||