Homo sapiens Gene: GTF2A1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-14595.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GTF2A1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | TF2A1; TFIIA; TFIIA-42; TFIIAL | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000165417 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa
general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa
general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Accurate transcription initiation on TATA-containing class II genes involves the ordered assembly of RNA polymerase II (POLR2A; MIM 180660) and several general initiation factors (summarized by DeJong and Roeder, 1993 [PubMed 8224848]). One of these factors is TFIIA, which when purified from HeLa extracts consists of 35-, 19-, and 12-kD subunits.[supplied by OMIM, Jul 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:81175452-81221377 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q31.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 50 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 15 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening pathway
RNA Polymerase II Pre-transcription Events pathway
RNA Polymerase II Promoter Escape pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance pathway
HIV Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II HIV Promoter Escape pathway
Transcription of the HIV genome pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Basal transcription factors pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.592334 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001278940 NM_015859 NM_201595 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9873 CCDS9874 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 02748 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||