Mus musculus Gene: Ptgds | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-145983.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ptgds | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | prostaglandin D2 synthase (brain) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 21kDa; L-PGDS; PGD2; PGDS; PGDS2; Ptgs3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000015090 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
prostaglandin D2 synthase (brain)
prostaglandin D2 synthase (brain)
prostaglandin D2 synthase (brain)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000107317:
The protein encoded by this gene is a glutathione-independent prostaglandin D synthase that catalyzes the conversion of prostaglandin H2 (PGH2) to postaglandin D2 (PGD2). PGD2 functions as a neuromodulator as well as a trophic factor in the central nervous system. PGD2 is also involved in smooth muscle contraction/relaxation and is a potent inhibitor of platelet aggregation. This gene is preferentially expressed in brain. Studies with transgenic mice overexpressing this gene suggest that this gene may be also involved in the regulation of non-rapid eye movement sleep. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:25466709-25470046 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | A3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX) pathway
Arachidonic acid metabolism pathway
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KEGG |
Arachidonic acid metabolism pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX) pathway
Arachidonic acid metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
Arachidonic acid metabolism pathway
Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX) pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Arachidonic acid metabolism pathway
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INOH |
Prostaglandin Leukotriene metabolism pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.1008 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008963 XM_006497786 XM_006497787 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38074 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||