Mus musculus Gene: Gcnt2 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-146446.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gcnt2 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2, I-branching enzyme | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 5330430K10Rik; IGnT; IGnTA; IGnTB; IGnTC | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021360 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2, I-branching enzyme
glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2, I-branching enzyme
glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2, I-branching enzyme
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000111846:
This gene encodes the enzyme responsible for formation of the blood group I antigen. The i and I antigens are distinguished by linear and branched poly-N-acetyllactosaminoglycans, respectively. The encoded protein is the I-branching enzyme, a beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase responsible for the conversion of fetal i antigen to adult I antigen in erythrocytes during embryonic development. Mutations in this gene have been associated with adult i blood group phenotype. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:40859768-40960891 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | A3.3 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Glycosphingolipid biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Glycosphingolipid biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3UJ01 Q7TPQ8 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 14538 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.314757 Mm.470743 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_133219 NM_008105 NM_023887 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26469 CCDS26468 CCDS36637 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1100870 | ||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Gcnt2 | ||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC133496 AC159205 AK146679 AY435150 BC054845 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH54845 AAR95651 BAE27354 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 14538 | ||||||||||||||||||||||||