Mus musculus Gene: Slc9a6 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-146858.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Slc9a6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000060681 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 6
solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 6
solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000198689:
This gene encodes a sodium-hydrogen exchanger that is amember of the solute carrier family 9. The encoded protein localizes to early and recycling endosomes and may be involved in regulating endosomal pH and volume. Defects in this gene are associated with X-linked syndromic mental retardation, Christianson type. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Apr 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome X:56609757-56664230 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | A6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cardiac muscle contraction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Sodium/Proton exchangers pathway
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
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KEGG |
Cardiac muscle contraction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B0QZV3 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 236794 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.17815 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_172780 XM_006527979 XM_006527980 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40979 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:2443511 | ||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Slc9a6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC048362 AL672085 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 236794 | ||||||||||||||||||||||||||||||