Mus musculus Gene: Jarid2 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-147776.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Jarid2 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | jumonji, AT rich interactive domain 2 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Jmj; jumonji | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000038518 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
jumonji, AT rich interactive domain 2
jumonji, AT rich interactive domain 2
jumonji, AT rich interactive domain 2
jumonji, AT rich interactive domain 2
jumonji, AT rich interactive domain 2
jumonji, AT rich interactive domain 2
jumonji, AT rich interactive domain 2
jumonji, AT rich interactive domain 2
jumonji, AT rich interactive domain 2
jumonji, AT rich interactive domain 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000008083:
This gene encodes a Jumonji- and AT-rich interaction domain (ARID)-domain-containing protein. The encoded protein is a DNA-binding protein that functions as a transcriptional repressor. This protein interacts with the Polycomb repressive complex 2 (PRC2) which plays an essential role in regulating gene expression during embryonic development. This protein facilitates the recruitment of the PRC2 complex to target genes. Alternate splicing results in multiple transcript variants. Mutations in this gene are associated with chronic myeloid malignancies. [provided by RefSeq, May 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:44729474-44921643 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | A5 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 21 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PRC2 methylates histones and DNA pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PRC2 methylates histones and DNA pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
Gene Expression pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q62315 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3UXE0 G3UXT1 G3UZQ8 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16468 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.25059 Mm.470471 Mm.488682 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021878 NM_001205043 NM_001205044 XM_006516855 XM_006516856 XM_006516857 XM_006516858 XM_006516859 XM_006516860 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36646 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:104813 | ||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Jarid2 | ||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC166074 AC170597 AK045214 AK147226 AK164134 BC003374 BC052444 BC060695 CH466546 D31967 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH03374 AAH52444 AAH60695 BAA06736 BAC32264 BAE27780 BAE37641 EDL41007 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 16468 | ||||||||||||||||||||||||