Mus musculus Gene: Puf60 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-152633.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Puf60 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | poly-U binding splicing factor 60 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2410104I19Rik; 2810454F19Rik; SIAHBP1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000002524 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
poly-U binding splicing factor 60
poly-U binding splicing factor 60
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000179950:
This gene encodes a nucleic acid-binding protein that plays a role in a variety of nuclear processes, including pre-mRNA splicing and transcriptional regulation. The encoded protein forms a complex with the far upstream DNA element (FUSE) and FUSE-binding protein at the myelocytomatosis oncogene (MYC) promoter. This complex represses MYC transcription through the core-TFIIH basal transcription factor. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:76070184-76080946 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 81 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TSLP pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.29965 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001164600 NM_028364 NM_133691 XM_006521302 XM_006521303 XM_006521304 XM_006521305 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37111 CCDS37112 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||