Mus musculus Gene: Spna2 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-154896.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Spna2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | spectrin alpha 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2610027H02Rik; Spna-2; Spna2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000057738 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
spectrin alpha 2
spectrin alpha 2
spectrin alpha 2
spectrin alpha 2
spectrin alpha 2
spectrin alpha 2
spectrin alpha 2
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000197694:
Spectrins are a family of filamentous cytoskeletal proteins that function as essential scaffold proteins that stabilize the plasma membrane and organize intracellular organelles. Spectrins are composed of alpha and beta dimers that associate to form tetramers linked in a head-to-head arrangement. This gene encodes an alpha spectrin that is specifically expressed in nonerythrocytic cells. The encoded protein has been implicated in other cellular functions including DNA repair and cell cycle regulation. Mutations in this gene are the cause of early infantile epileptic encephalopathy-5. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Sep 2010] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:29965560-30031451 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 31 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 102 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Apoptosis pathway
Nephrin interactions pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins pathway
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
Axon guidance pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Cell-Cell communication pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
Apoptotic execution phase pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins pathway
Apoptotic cleavage of cellular proteins pathway
Apoptotic execution phase pathway
Nephrin interactions pathway
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
Developmental Biology pathway
Cell-Cell communication pathway
Axon guidance pathway
Apoptosis pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
Tight junction pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Caspase Cascade in Apoptosis
|
||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.204969 Mm.400289 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001076554 NM_001177667 NM_001177668 XM_006497812 XM_006497813 XM_006497814 XM_006497815 XM_006497816 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38094 CCDS50558 CCDS50559 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||