Mus musculus Gene: Tnc | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155840.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tnc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tenascin C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | AI528729; C130033P17Rik; cytotactin; Hxb; Ten; tenascin-C; TN; TN-C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028364 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tenascin C
tenascin C
tenascin C
tenascin C
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000041982:
This gene encodes an extracellular matrix protein with a spatially and temporally restricted tissue distribution. This protein is homohexameric with disulfide-linked subunits, and contains multiple EGF-like and fibronectin type-III domains. It is implicated in guidance of migrating neurons as well as axons during development, synaptic plasticity, and neuronal regeneration. [provided by RefSeq, Jul 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:63959785-64047015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Syndecan interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
Integrin cell surface interactions pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Integrin cell surface interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
Syndecan interactions pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Alpha9 beta1 integrin signaling events
Syndecan-4-mediated signaling events
Beta3 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q80YX1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8C9Z1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.454219 Mm.980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_011607 XM_006537774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18265 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:101922 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tnc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK040167 AL732556 D90343 X56304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | BAA14355 BAC30529 CAA39751 CAD83047 CAD83048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 21923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||