Mus musculus Gene: Vldlr | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-155959.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vldlr | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | very low density lipoprotein receptor | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA408956; AI451093; AW047288 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024924 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
very low density lipoprotein receptor
very low density lipoprotein receptor
very low density lipoprotein receptor
very low density lipoprotein receptor
very low density lipoprotein receptor
very low density lipoprotein receptor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Vldlr is exploited by rhinovirus for viral entry. Vldlr protein levels are negatively regulated by IFN/RIG-I signalling via MIR23B. (Demonstrated in human)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] VLDLR is exploited by rhinovirus for viral entry. VLDLR protein levels are negatively regulated by IFN/RIG-I signalling via MIR23B.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000147852:
The low density lipoprotein receptor (LDLR) gene family consists of cell surface proteins involved in receptor-mediated endocytosis of specific ligands. This gene encodes a lipoprotein receptor that is a member of the LDLR family and plays important roles in VLDL-triglyceride metabolism and the reelin signaling pathway. Mutations in this gene cause VLDLR-associated cerebellar hypoplasia. Alternative splicing generates multiple transcript variants encoding distinct isoforms for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:27216484-27254231 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 10 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Reelin signaling pathway
Urokinase-type plasminogen activator (uPA) and uPAR-mediated signaling
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.405973 Mm.4141 Mm.488198 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001161420 NM_013703 XM_006526917 XM_006526918 XM_006526919 XM_006526920 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29721 CCDS50411 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||