Mus musculus Gene: Vsx2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-156854.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Vsx2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | visual system homeobox 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Chx10; Hox-10; Hox10; or | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021239 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
visual system homeobox 2
visual system homeobox 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the Vsx (visual system homeobox) family which belongs to the larger PRD homeobox class. The encoded protein is required for eye organogenesis and controls retinal development. Disruption of this gene is associated with ocular retardation J (orJ), a mouse disease which causes microphthalmia, retinal degeneration and optic nerve aplasia. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:84569762-84595457 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | D1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q3TSC7 Q6PDC1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12677 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4405 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XM_006515453 NM_007701 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36493 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:88401 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Vsx2 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AC110564 AK162139 BC058806 CH466590 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH58806 BAE36748 EDL02809 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 12677 | ||||||||||||||||||||||