Mus musculus Gene: Tgfbi | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-157426.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tgfbi | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | transforming growth factor, beta induced | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 68kDa; AI181842; AI747162; Beta-ig; big-h3 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000035493 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transforming growth factor, beta induced
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000120708:
This gene encodes an RGD-containing protein that binds to type I, II and IV collagens. The RGD motif is found in many extracellular matrix proteins modulating cell adhesion and serves as a ligand recognition sequence for several integrins. This protein plays a role in cell-collagen interactions and may be involved in endochondrial bone formation in cartilage. The protein is induced by transforming growth factor-beta and acts to inhibit cell adhesion. Mutations in this gene are associated with multiple types of corneal dystrophy. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:56609603-56639339 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Disease pathway
Amyloids pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Amyloids pathway
Disease pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Beta2 integrin cell surface interactions
Beta3 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P82198 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A1L353 Q19PV3 Q3TDZ5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 21810 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.14455 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009369 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS36680 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:99959 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tgfbi | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK084431 AK142323 AK151680 AK152365 AK155572 AK155828 AK169912 AK170495 BC129900 CH466546 DQ512871 DQ512872 L19932 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC37658 AAI29901 ABF72418 ABF72419 BAC39181 BAE25032 BAE30605 BAE31155 BAE33330 BAE33452 BAE41453 BAE41834 EDL41243 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 21810 | ||||||||||||||||||||||