Mus musculus Gene: Tgoln1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-157902.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tgoln1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | trans-golgi network protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AU015504; D6Ertd384e; TGN38; TGN38A; TGN38B; TGN41; TGN46; Ttgn1; Ttgn2 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000056429 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
trans-golgi network protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000152291:
This gene encodes a type I integral membrane protein that is localized to the trans-Golgi network, a major sorting station for secretory and membrane proteins. The encoded protein cycles between early endosomes and the trans-Golgi network, and may play a role in exocytic vesicle formation. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:72608432-72617000 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Membrane Trafficking pathway
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q62313 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q4FJY3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22135 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.246563 Mm.467046 Mm.467667 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009443 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS51811 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:105080 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Tgoln1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK041302 AK076586 AK133559 AK161242 AK162574 BC009143 BC141218 BC145542 CH466523 CT010269 D50031 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH09143 AAI41219 AAI45543 BAA08757 BAC30896 BAC36404 BAE21726 BAE36262 BAE36972 CAJ18477 EDK98990 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 22134 22135 | ||||||||||||||||||||||