Mus musculus Gene: Smg5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-160313.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Smg5 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000001415 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000198952:
SMG5 is involved in nonsense-mediated mRNA decay (Ohnishi et al., 2003 [PubMed 14636577]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:88336260-88362337 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by HDAC Class I
Regulation of Telomerase
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.439830 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_178246 XM_006501343 XM_006501344 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38480 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||