Mus musculus Gene: Lrsam1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-161846.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lrsam1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026792 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1
leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1
leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1
leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1
leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1
leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1
leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000148356:
This gene encodes a ring finger protein involved in a variety of functions, including regulation of signaling pathways and cell adhesion, mediation of self-ubiquitylation, and involvement in cargo sorting during receptor endocytosis. Mutations in this gene have been associated with Charcot-Marie-Tooth disease. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:32925216-32961614 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 34 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Immune System pathway
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.248037 Mm.490880 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_199302 XM_006497962 XM_006497963 XM_006497964 XM_006497965 XM_006497966 XM_006497967 XM_006497969 XM_006497970 XM_006497971 XM_006497972 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15935 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||