Mus musculus Gene: Comp | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-162847.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Comp | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | cartilage oligomeric matrix protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | TSP5 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031849 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cartilage oligomeric matrix protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000105664:
The protein encoded by this gene is a noncollagenous extracellular matrix (ECM) protein. It consists of five identical glycoprotein subunits, each with EGF-like and calcium-binding (thrombospondin-like) domains. Oligomerization results from formation of a five-stranded coiled coil and disulfides. Binding to other ECM proteins such as collagen appears to depend on divalent cations. Mutations can cause the osteochondrodysplasias pseudochondroplasia (PSACH) and multiple epiphyseal dysplasia (MED). [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:70373548-70382065 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B3.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Integrin cell surface interactions pathway
ECM proteoglycans pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
Malaria pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Integrin cell surface interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
ECM proteoglycans pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
Malaria pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.45071 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016685 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22367 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||