Mus musculus Gene: Lgi1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-162948.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lgi1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | leucine-rich repeat LGI family, member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | BB130740 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000067242 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
leucine-rich repeat LGI family, member 1
leucine-rich repeat LGI family, member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000108231:
This gene is rearranged as a result of translocations in glioblastoma cell lines. The protein contains a hydrophobic segment representing a putative transmembrane domain with the amino terminus located outside the cell. It also contains leucine-rich repeats with conserved cysteine-rich flanking sequences. This gene is predominantly expressed in neural tissues and its expression is reduced in low grade brain tumors and significantly reduced or absent in malignant gliomas. Mutations in this gene result in autosomal dominant lateral temporal epilepsy. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:38264782-38308939 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9JIA1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 56839 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.298251 Mm.397938 Mm.455456 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_020278 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29786 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1861691 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Lgi1 | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF246818 AK045443 BC066090 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF87077 AAH66090 BAC32370 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 56839 | ||||||||||||||||||||||