Mus musculus Gene: Adar | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-164791.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Adar | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | adenosine deaminase, RNA-specific | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Adar1; Adar1p110; Adar1p150; AV242451; mZaADAR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
adenosine deaminase, RNA-specific
adenosine deaminase, RNA-specific
adenosine deaminase, RNA-specific
adenosine deaminase, RNA-specific
adenosine deaminase, RNA-specific
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Adar destabalizes RNA structure by the deamination of adenosine to inosine, and therefore is able to disrupt replication of dsRNA viruses in the host.
Transcriptional activation of Adar by IFN occurs in the absence of Stat1 by a non-canonical Stat2-dependent pathway.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] ADAR destabalizes RNA structure by the deamination of adenosine to inosine, and therefore is able to disrupt replication of dsRNA viruses in the host.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000160710:
This gene encodes the enzyme responsible for RNA editing by site-specific deamination of adenosines. This enzyme destabilizes double-stranded RNA through conversion of adenosine to inosine. Mutations in this gene have been associated with dyschromatosis symmetrica hereditaria. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:89715022-89753446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | F1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Editing: A to I Conversion pathway
C6 deamination of adenosine pathway
Gene Expression pathway
Formation of editosomes by ADAR proteins pathway
mRNA Editing pathway
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KEGG |
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
C6 deamination of adenosine pathway
Formation of editosomes by ADAR proteins pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
mRNA Editing pathway
Gene Expression pathway
mRNA Editing: A to I Conversion pathway
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KEGG |
Cytosolic DNA-sensing pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.316628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001038587 NM_001146296 NM_019655 XM_006501752 XM_006501753 XM_006501754 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17513 CCDS17514 CCDS50963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||