Mus musculus Gene: Slc6a3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-165714.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Slc6a3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, dopamine), member 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | DAT; Dat1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021609 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, dopamine), member 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000142319:
This gene encodes a dopamine transporter which is a member of the sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter family. The 3' UTR of this gene contains a 40 bp tandem repeat, referred to as a variable number tandem repeat or VNTR, which can be present in 3 to 11 copies. Variation in the number of repeats is associated with idiopathic epilepsy, attention-deficit hyperactivity disorder, dependence on alcohol and cocaine, susceptibility to Parkinson disease and protection against nicotine dependence.[provided by RefSeq, Nov 2009] This gene encodes a dopamine transporter which is a member of the sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter family. The 3\' UTR of this gene contains a 40 bp tandem repeat, referred to as a variable number tandem repeat or VNTR, which can be present in 3 to 11 copies. Variation in the number of repeats is associated with idiopathic epilepsy, attention-deficit hyperactivity disorder, dependence on alcohol and cocaine, susceptibility to Parkinson disease and protection against nicotine dependence.[provided by RefSeq, Nov 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 13:73536747-73578672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 12 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 15 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Transport of glucose and other sugars, bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Dopamine clearance from the synaptic cleft pathway
Neurotransmitter Clearance In The Synaptic Cleft pathway
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
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KEGG |
Parkinson's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters pathway
Transport of glucose and other sugars, bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds pathway
Dopamine clearance from the synaptic cleft pathway
Neurotransmitter Clearance In The Synaptic Cleft pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Neuronal System pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
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KEGG |
Parkinson's disease pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Alpha-synuclein signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q61327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 13162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.41993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010020 XM_006517082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:94862 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Slc6a3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF109072 AH003328 BC054119 U16265 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA86462 AAC52283 AAD19643 AAH54119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 13162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||