Mus musculus Gene: H2-Oa | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-170180.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | H2-Oa | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | histocompatibility 2, O region alpha locus | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | H-2Oa | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024334 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
histocompatibility 2, O region alpha locus
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000204252:
HLA-DOA belongs to the HLA class II alpha chain paralogues. HLA-DOA forms a heterodimer with HLA-DOB. The heterodimer, HLA-DO, is found in lysosomes in B cells and regulates HLA-DM-mediated peptide loading on MHC class II molecules. In comparison with classical HLA class II molecules, this gene exhibits very little sequence variation, especially at the protein level. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:34092340-34095234 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | B1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Type I diabetes mellitus pathway
Antigen processing and presentation pathway
Asthma pathway
Allograft rejection pathway
Graft-versus-host disease pathway
Systemic lupus erythematosus pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
Viral myocarditis pathway
Staphylococcus aureus infection pathway
Leishmaniasis pathway
Phagosome pathway
Toxoplasmosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
MHC class II antigen presentation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Cell adhesion molecules (CAMs) pathway
Antigen processing and presentation pathway
Type I diabetes mellitus pathway
Allograft rejection pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
Systemic lupus erythematosus pathway
Graft-versus-host disease pathway
Asthma pathway
Intestinal immune network for IgA production pathway
Viral myocarditis pathway
Leishmaniasis pathway
Staphylococcus aureus infection pathway
Toxoplasmosis pathway
Phagosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9QWV1 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 15001 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.116 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_008206 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37577 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:95924 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | H2-Oa | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AF100956 AK020594 AK170742 CH466660 CR974462 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC69906 BAB32142 BAE41995 EDL10251 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 15001 | ||||||||||||||||||||||