Mus musculus Gene: Lsm6 | |||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-170209.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lsm6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1500031N17Rik; 2410088K19Rik; AI747288 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000031683 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
|
||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000164167:
Sm-like proteins were identified in a variety of organisms based on sequence homology with the Sm protein family (see SNRPD2; MIM 601061). Sm-like proteins contain the Sm sequence motif, which consists of 2 regions separated by a linker of variable length that folds as a loop. The Sm-like proteins are thought to form a stable heteromer present in tri-snRNP particles, which are important for pre-mRNA splicing.[supplied by OMIM, Apr 2004] |
||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:78804865-78821140 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 23 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease pathway
Gene Expression pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA degradation pathway
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Gene Expression pathway
|
||||||||||||||||||||||
KEGG |
RNA degradation pathway
Spliceosome pathway
|
||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.28694 Mm.390410 Mm.400222 Mm.415220 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001191004 NM_030145 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS40396 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||