Mus musculus Gene: Ppara | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-170640.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ppara | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | peroxisome proliferator activated receptor alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4933429D07Rik; AW742785; Nr1c1; Ppar; PPAR-alpha; PPARalpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
peroxisome proliferator activated receptor alpha
peroxisome proliferator activated receptor alpha
peroxisome proliferator activated receptor alpha
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000186951:
Peroxisome proliferators include hypolipidemic drugs, herbicides, leukotriene antagonists, and plasticizers; this term arises because they induce an increase in the size and number of peroxisomes. Peroxisomes are subcellular organelles found in plants and animals that contain enzymes for respiration and for cholesterol and lipid metabolism. The action of peroxisome proliferators is thought to be mediated via specific receptors, called PPARs, which belong to the steroid hormone receptor superfamily. PPARs affect the expression of target genes involved in cell proliferation, cell differentiation and in immune and inflammation responses. Three closely related subtypes (alpha, beta/delta, and gamma) have been identified. This gene encodes the subtype PPAR-alpha, which is a nuclear transcription factor. Multiple alternatively spliced transcript variants have been described for this gene, although the full-length nature of only two has been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 15:85734983-85802819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | E2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 34 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Bmal1:Clock,Npas2 activates circadian gene expression pathway
Rora activates circadian gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Mus musculus biological processes pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Circadian Clock pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
Orphan transporters pathway
Metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Gene Expression pathway
PPARA activates gene expression pathway
Developmental Biology pathway
YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
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KEGG |
PPAR signaling pathway pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Activation of gene expression by SREBF (SREBP) pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
RORA activates circadian gene expression pathway
BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression pathway
REV-ERBA represses gene expression pathway
Circadian Clock pathway
Nuclear Receptor transcription pathway pathway
YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression pathway
Generic Transcription Pathway pathway
Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Organelle biogenesis and maintenance pathway
Developmental Biology pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Mitochondrial biogenesis pathway
Orphan transporters pathway
Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis pathway
Metabolism pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
PPAR signaling pathway pathway
Adipocytokine signaling pathway pathway
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.212789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001113418 NM_011144 XM_006520619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||