Homo sapiens Gene: GDNF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-17169.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GDNF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | glial cell derived neurotrophic factor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ATF1; ATF2; HFB1-GDNF; HSCR3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000168621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
glial cell derived neurotrophic factor
glial cell derived neurotrophic factor
glial cell derived neurotrophic factor
glial cell derived neurotrophic factor
glial cell derived neurotrophic factor
glial cell derived neurotrophic factor
glial cell derived neurotrophic factor
glial cell derived neurotrophic factor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a highly conserved neurotrophic factor. The recombinant form of this protein was shown to promote the survival and differentiation of dopaminergic neurons in culture, and was able to prevent apoptosis of motor neurons induced by axotomy. The encoded protein is processed to a mature secreted form that exists as a homodimer. The mature form of the protein is a ligand for the product of the RET (rearranged during transfection) protooncogene. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. Mutations in this gene may be associated with Hirschsprung disease. [provided by RefSeq, Jun 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:37812677-37839686 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p13.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
NCAM1 interactions pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
GPCR signaling pathway
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PID NCI |
Signaling events regulated by Ret tyrosine kinase
Posttranslational regulation of adherens junction stability and dissassembly
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.248114 Hs.609874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000514 NM_001190468 NM_001190469 NM_001278098 NM_199231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3922 CCDS3923 CCDS54845 CCDS54846 CCDS75237 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||