Mus musculus Gene: Csf2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-172875.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Csf2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Csfgm; Gm-CSf; GMCSF; MGI-IGM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000018916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
CSF2 is a negative regulator of IL21-mediated apoptosis in conventional dendritic cells.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000164400:
The protein encoded by this gene is a cytokine that controls the production, differentiation, and function of granulocytes and macrophages. The active form of the protein is found extracellularly as a homodimer. This gene has been localized to a cluster of related genes at chromosome region 5q31, which is known to be associated with interstitial deletions in the 5q- syndrome and acute myelogenous leukemia. Other genes in the cluster include those encoding interleukins 4, 5, and 13. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:54247271-54249667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | B1.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
GPCR downstream signaling pathway
Hemostasis pathway
Signaling by GPCR pathway
Interleukin-2 signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Immune System pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
GPVI-mediated activation cascade pathway
Interleukin receptor SHC signaling pathway
Signaling by Interleukins pathway
G-protein beta:gamma signalling pathway
Interleukin-3, 5 and GM-CSF signaling pathway
Signal Transduction pathway
G beta:gamma signalling through PI3Kgamma pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
Hematopoietic cell lineage pathway
T cell receptor signaling pathway pathway
Fc epsilon RI signaling pathway pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
Amoebiasis pathway
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INOH |
JAK STAT pathway and regulation pathway
GPCR signaling pathway
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PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interleukin receptor SHC signaling pathway
Interleukin-3, 5 and GM-CSF signaling pathway
Interleukin-2 signaling pathway
GPVI-mediated activation cascade pathway
G beta:gamma signalling through PI3Kgamma pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Signaling by GPCR pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
G-protein beta:gamma signalling pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
Hemostasis pathway
Signaling by GPCR pathway
Interleukin-2 signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Hemostasis pathway
Immune System pathway
Interleukin receptor SHC signaling pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Signal Transduction pathway
GPVI-mediated activation cascade pathway
GPCR downstream signaling pathway
G-protein beta:gamma signalling pathway
Interleukin-3, 5 and GM-CSF signaling pathway
Signaling by Interleukins pathway
G beta:gamma signalling through PI3Kgamma pathway
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KEGG |
Hematopoietic cell lineage pathway
Fc epsilon RI signaling pathway pathway
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
T cell receptor signaling pathway pathway
Jak-STAT signaling pathway pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
Amoebiasis pathway
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INOH |
JAK STAT pathway and regulation pathway
GPCR signaling pathway
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PID NCI |
Syndecan-2-mediated signaling events
Calcium signaling in the CD4+ TCR pathway
Regulation of retinoblastoma protein
Calcineurin-regulated NFAT-dependent transcription in lymphocytes
Alpha9 beta1 integrin signaling events
AP-1 transcription factor network
Glucocorticoid receptor regulatory network
GMCSF-mediated signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P01587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q5SX78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.4922 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_009969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS24692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1339752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Csf2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK053196 CH466575 EU366957 M11848 X02333 X03019 X03020 X05906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA37483 ABY66391 BAE20692 CAA26192 CAA26193 CAA26820 CAA26821 CAA29336 EDL33540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 12981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||