Mus musculus Gene: Grik1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-173771.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Grik1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | glutamate receptor, ionotropic, kainate 1 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | A830007B11Rik; D16Ium24; D16Ium24e; GluK1; GluK5; Glur-5; Glur5; Glurbeta1 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022935 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
glutamate receptor, ionotropic, kainate 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Glutamate receptors are the predominant excitatory neurotransmitter receptors in the mammalian brain and are activated in a variety of normal neurophysiologic processes. This gene product belongs to the kainate family of glutamate receptors, which are composed of four subunits and function as ligand-activated ion channels. The subunit encoded by this gene is subject to RNA editing (CAG->CGG; Q->R) within the second transmembrane domain, which is thought to alter the properties of ion flow. Alternative splicing, resulting in transcript variants encoding different isoforms, has been noted for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] Glutamate receptors are the predominant excitatory neurotransmitter receptors in the mammalian brain and are activated in a variety of normal neurophysiologic processes. This gene product belongs to the kainate family of glutamate receptors, which are composed of four subunits and function as ligand-activated ion channels. The subunit encoded by this gene is subject to RNA editing (CAG->CGG; Q->R) within the second transmembrane domain, which is thought to alter the properties of ion flow. Alternative splicing, resulting in transcript variants encoding different isoforms, has been noted for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:87896196-88056176 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | C3.3 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Activation of Na-permeable Kainate Receptors pathway
Neuronal System pathway
Ionotropic activity of Kainate Receptors pathway
Activation of Kainate Receptors upon glutamate binding pathway
Transmission across Chemical Synapses pathway
Activation of Ca-permeable Kainate Receptor pathway
Neurotransmitter Receptor Binding And Downstream Transmission In The Postsynaptic Cell pathway
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KEGG |
Neuroactive ligand-receptor interaction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.403860 Mm.5134 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_010348 NM_146072 XM_006522917 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||