Mus musculus Gene: Ccl20 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-174322.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ccl20 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | chemokine (C-C motif) ligand 20 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CKb4; exodus-1; LARC; MIP-3[a]; MIP-3A; MIP3A; Scya20; ST38 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026166 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
chemokine (C-C motif) ligand 20
chemokine (C-C motif) ligand 20
chemokine (C-C motif) ligand 20
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000115009:
This antimicrobial gene belongs to the subfamily of small cytokine CC genes. Cytokines are a family of secreted proteins involved in immunoregulatory and inflammatory processes. The CC cytokines are proteins characterized by two adjacent cysteines. The protein encoded by this gene displays chemotactic activity for lymphocytes and can repress proliferation of myeloid progenitors. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 1:83116766-83119167 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | C5 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
GPCR downstream signaling pathway
Signaling by GPCR pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
GPCR ligand binding pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
G alpha (i) signalling events pathway
Chemokine receptors bind chemokines pathway
Peptide ligand-binding receptors pathway
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors) pathway
Signaling by GPCR pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
GPCR ligand binding pathway
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KEGG |
Cytokine-cytokine receptor interaction pathway
Chemokine signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O89093 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8WHA7 Q54AI7 Q642U4 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20297 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.116739 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001159738 NM_016960 XM_006496447 XM_006496448 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35632 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1329031 | ||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ccl20 | ||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB015136 AB015137 AC123676 AF053313 AF099052 AJ007862 AJ222694 BC028504 CH466629 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC78295 AAC78680 AAH28504 BAA76955 BAA78113 CAA07714 CAA10948 EDL02154 EDL02156 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 20297 | ||||||||||||||||||||||||