Mus musculus Gene: Ttc21b | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-175095.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ttc21b | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | tetratricopeptide repeat domain 21B | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2410066K11Rik; aln; mKIAA1992; Thm1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000034848 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tetratricopeptide repeat domain 21B
tetratricopeptide repeat domain 21B
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000123607:
This gene encodes a member of TTC21 family, containing several tetratricopeptide repeat (TPR) domains. This protein is localized to the cilium axoneme, and may play a role in retrograde intraflagellar transport in cilia. Mutations in this gene are associated with various ciliopathies, nephronophthisis 12, and asphyxiating thoracic dystrophy 4. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:66184327-66256617 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | C1.3 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Hedgehog 'off' state pathway
Signaling by Hedgehog pathway
Signal Transduction pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Signaling by Hedgehog pathway
Signal Transduction pathway
Hedgehog 'off' state pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q0HA38 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PVK4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 73668 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.250868 Mm.411332 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001047604 NM_001290669 XM_006500263 XM_006500264 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS16076 CCDS71061 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | MGI:1920918 | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ttc21b | ||||||||||||||||||||||
EMBL | AK132240 AK173320 AL844526 AL928586 DQ011164 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAY79164 BAD32598 BAE21052 CAM17348 CAM21880 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 73668 | ||||||||||||||||||||||